Les systèmes de fichiers Linux et Unix sont organisés selon une structure hiérarchique, en forme d'arbre. Le niveau le plus élevé du système de fichier est /, encore appelé répertoire (ou dossier) racine. Sous Unix ou Linux, tout est vu comme des fichiers - disques durs, partitions, supports amovibles, etc. Cela signifie que tous les autres fichiers et répertoires (y compris les autres disques et partitions) sont placés en-dessous du répertoire racine.
Par exemple, /home/jebediah/fromages.odt est le chemin absolu du fichier fromages.odt qui se trouve dans le répertoire jebediah, lui-même situé dans le répertoire home qui se trouve lui aussi dans le répertoire racine (/).
En-dessous du répertoire racine (/) se trouve un ensemble de répertoires système importants et communs à la plupart des distributions Linux existantes. Ci-après sont listés les répertoires trouvés habituellement en dessous du répertoire racine (/) :

  • /bin - applications binaires importantes ;
  • /boot - fichiers de configuration du boot (amorçage) ;
  • /dev - fichiers de périphériques (devices) ;
  • /etc - fichiers de configuration, scripts de démarrage, etc. ;
  • /home - répertoires personnels (home) des utilisateurs ;
  • /lib - bibliothèques (libraries) système ;
  • /lost+found - fournit un système d'objets perdus+trouvés (lost+found) pour les fichiers se trouvant dans le répertoire racine (/) ;
  • /media - media montés (chargés) et éjectables commes des CDs, appareils photo numériques, clés USB, etc. ;
  • /mnt - systèmes de fichiers montés ;
  • /opt - emplacement pour installer des applications optionnelles ;
  • /proc - répertoire dynamique spécial qui tient à jour des informations sur l'état du système, y compris les processus actifs ;
  • /root - répertoire personnel du super-utilisateur (root), prononcez « slash-route » ;
  • /sbin - binaires système importants ;
  • /sys - fichiers système ;
  • /tmp - fichiers temporaires ;
  • /usr - applications et fichiers généralement accessibles à tous les utilisateurs (users) ;
  • /var - fichiers variables tels que journaux et bases de données.

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